洁净医疗场所的洁净室首先应用在手术室，也就是我们目前所说的医院手术室净化工程。起初只广泛应用于矫形手术，因为矫形手术时间长，且容易发生感染。 理想的控制级别是手术台附近的空气洁净度等级达到100级。一般建议使用质优的高效空气过滤系统，可覆盖面积至少为3m x 3m，包括手术台和人员。
其他使用洁净医疗场所的领域包括分娩室、保育室、烧伤室、心脏病患者护理室等。牙科手术也是使用洁净医疗场所的洁净室之一，这降低了医护人员长时间工作时感染的风险。
洁净室作为医院的重要功能区之一，其工程质量直接影响医院的使用和患者的。 提高洁净医疗场所的工程质量，必须同时注重设计、施工和维护。
