全面、专业的日常监控是洁净外科管理的有效途径。
建议常规设立的项目是：沉降菌浓度、悬浮菌浓度、含尘浓度、压差、风速和风量、温度、相对湿度。
悬浮菌浓度：主要用于动态监测外科手术中的实际细菌浓度，检测和预测特殊手术中综合因素下的感染风险。
含尘浓度：主要用于监测静态洁净度水平，定点检测大于或等于0.5μm的尘埃颗粒数和大于或等于5μm的尘埃颗粒数。
压差：主要用于监控洁净手术部内各区域的正常压差，防止发生由于气流走向错误而导致手术感染。
风速和风量：规范要求，局部100级作业区工作面，断面风速应控制在0.25～0.3m/s范围内。如果小于0.25m/s，可能会影响抗干扰能力。如果太大，可能会导致切口失水过快。尤其是在眼科手术中，如果风速太大，结膜会很快蒸发，失去水分，影响整个手术。
Ⅱ级、Ⅲ洁净手术室采用的是一种低湍流度的置换气流，是充填原理，出风速度不低于0.15m/s。
Ⅳ级准洁净手术室按一般乱流参数，是稀释原理，出口风速不少于0.25m/s，以保持动量将风送下。
更小新风量：更大值需满足以下条件：(1)每人每小时60立方米；(2)补偿室内排风、维持室内正压值的新风量；(3)规范规定的更小新风量。
温度：标准要求手术环境温度控制在22至25℃。手术环境的温度与手术切口的感染率密切相关。温度控制实际上是控制细菌浓度的有效手段。如果温度上限超过标准，就会导致医护人员体内细菌数量增加。
相对湿度：规格要求控制在40%到60%之间。相对湿度与细菌的存活率密切相关，适当的湿度是细菌的营养来源。据研究，当相对湿度为50%时，细菌漂浮并在10分钟内死亡。当相对湿度较高或较低时，大多数细菌即使在 24 小时后仍然存活。常温下，相对湿度超过60%时，就会发生霉菌。如果相对湿度高于80%，无论温度如何，都会发生霉菌。
